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Tese
Título Predição de valores genéticos de famílias e estrutura populacional de genitores em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) usando marcadores microssatélites
Autor Neto, Hugo Zeni
Unidade Pós-Graduação em Genética e Melhoramento
Área de Concentração Genética e Melhoramento
Orientador Prof. Dr. Pedro Soares Vidigal Filho
Co-Orientador(es) Prof. Dr. Maria Celeste Gonçalves Vidigal
Prof. Dr. Edelclaiton Daros
Banca Examinadora Prof. Dr. Pedro Soares Vidigal Filho
Prof. Dr. Edelclaiton Daros
Prof. Dr. João Carlos Bespalhok Filho
Prof. Dr. Carlos Alberto Scapim
Profª Drª Maria Celeste Gonçalves Vidigal
Data de Defesa 19/12/2011
Resumo O sucesso de um programa de melhoramento genético de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) reside na ambição da escolha dos genitores mais ricos e geneticamente divergentes. Um dos problemas encontrados nesses programas de melhoramento genético de cana-de-açúcar, é que nas fases iniciais de seleção, tendem a ser avaliadas características de baixa herdabilidade, por isso vem-se preferindo a adoção do procedimento de seleção de famílias ao invés da seleção massal. O presente trabalho teve como objetivo selecionar as melhores famílias de cana-de-açúcar que compõem a série RB05 da RIDESA adotando-se a metodologia dos modelos mistos (REML/BLUP) em duas safras, sob análise conjunta além de, estimar a divergência genética e estrutura populacional dos genitores que compuseram a referida série mediante o emprego de marcadores microssatélites (SSR). O experimento constitui-se em um delineamento de blocos Incompletos com 78 famílias que compõem a série RB05 em fase T1 do PMGCA/UFPR/RIDESA, cinco repetições por família e sendo considerados conjuntamente os dados oriundos dos anos agrícolas 2008/2009 e 2009/2010. Foram avaliadas as características BRIX, tonelada de colmo por hectare (TCH) e tonelada de Brix por hectare (TBH). As três melhores famílias para BRIX foram as F41M60, F02M77 e F41M82, para TCH foram as F66M30, F35M06 e F78M45, e para TBH foram as F66M30, F35M06 e F78M45. A análise conjunta demonstrou ser uma ferramenta primordial para o uso dos melhoristas na aplicação da seleção de famílias, pois pode haver ordenação diferenciada das melhores famílias ao longo das safras. Na avaliação molecular da divergência genética e estrutura populacional dos 82 acessos de cana-de-açúcar, os quais são os genitores das famílias da série RB05, mediante o emprego de 36 primers microssatélites (SSR) demonstraram, sob o uso do coeficiente de similaridade de Jaccard e do método de agrupamento UPGMA, um agrupamento dividido em 17 grupos distintos. Os primers evidenciaram 319 alelos, variando de 2 a 19 locos com uma média por primer de 8,86. Os valores de PIC variaram de 0,1527 até 0,9264 com uma média de 0,5705. O respectivo coeficiente de similaridade utilizado demonstrou que o grau de semelhança variou de 0,4716 (RB965586 x RB971551) a 0,9526 (RB936001 x SP89-1115) com média de 0,8536 evidenciando uma elevada similaridade entre os 82 indivíduos analisados. Os resultados indicam que os locos de SSRs podem ser utilizados para construção de grupos divergentes de cana-de-açúcar para serem utilizados futuramente nos próximos cruzamentos entre cultivares pouco similares entre si a fim de gerar indivíduos com um alto grau heterótico.
Palavras-chave parâmetros genéticos; modelos mistos; SSR
Title
Abstract The success of a program of genetic improvement of sugarcane (Saccharum spp.)
resides in the ambition of parents choosing the richest and most genetically
divergent. One of the problems encountered in these programs of genetic
improvement of sugarcane, is that in the early stages of selection, tend to be
evaluated traits with low heritability, so it comes to preferring the adoption of the
procedure for selection of families instead of mass selection. The present work aimed
to select the best families of sugarcane that make up the RB05 Series of RIDESA
adopting the methodology of mixed models (REML/BLUP) in two crops, as well as in
joint analysis, estimate the genetic divergence and population structure that made up
this series by the use of microsatellite markers (SSR). The experiment consisted in
an incomplete block design with 78 families making up the series RB05, phase T1 of
PMGCA/UFPR/RIDESA, five replicates per family and are considered together the
data from the agricultural years 2008/2009 and 2009/2010. The characteristics
evaluated were BRIX, tons of sugarcane per hectare (TCH) and ton of Brix per
hectare (TBH). The top three families were for BRIX F41M60, F02M77 and F41M82
to TCH were F66M30, F35M06 and F78M45, and to TBH were F66M30, F35M06
and F78M45. The joint analysis proved to be a primary tool for use by breeders in the
application of the families selection, because there may be different ordering of the
best families throughout the seasons. In the evaluation of molecular genetic diversity
and population structure of 82 accessions of sugarcane, which are the parents of
families RB05 Series, through the use of 36 primers microsatellites (SSR)
demonstrated, under the use of the similarity coefficient Jaccard and UPGMA
method, a cluster divided into 17 distinct groups. The primers showed 319 alleles,
ranging from 2 to 19 locis with an average of 8.86 per primer. The PIC values ranged
from 0.1527 to 0.9264 with an average of 0.5705. The corresponding similarity
coefficient used demonstrated that the degree of similarity ranged from 0.4716
(RB965586 x RB971551) to 0.9526 (RB936001 x SP89-1115) with an average of
0.8536 showing a high similarity among the 82 individuals analyzed. The results
indicate that SSRs can be used for construction of divergent groups of sugarcane to
be used in future crosses between cultivars in the next little bit similar to each other
to generate individuals with a high heterotic degree.
Key-words genetics parameters; mixed models; SSR.
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