Sexta, 29 de março de 2024.
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Tese
Título Caracterização de germoplasma de feijoeiro comum e identificação de fontes de resistência ao Colletotrichum lindemuthianum utilizando marcadores moleculares
Autor Molina, Juliana Cristiani
Unidade Pós-Graduação em Genética e Melhoramento
Área de Concentração Genética e Melhoramento
Orientador Profª Drª Maria Celeste Gonçalves Vidigal
Co-Orientador(es) Profª Drª Adriana Gonela
Prof. Dr. Pedro Soares Vidigal Filho
Profª Drª Vania Moda-Cirino
Banca Examinadora Profª Drª Maria Celeste Gonçalves Vidigal
Prof. Dr. Pedro Soares Vidigal Filho
Profª Drª Adriana Gonela
Profª Drª Juliana Parisotto Poletine
Profª Drª Vania Moda-Cirino
Data de Defesa 21/12/2006
Resumo A fim de quantificar a quantidade de variabilidade genética e identificar fontes de resistência à antracnose, 40 acessos do feijoeiro comum pertencentes ao Núcleo de Pesquisas Aplicadas à Agricultura (Nupagri), da Universidade Estadual de Maringá (UEM) e 233 isolinhas F2RC3, derivadas do retrocruzamento Pérola x G 2333, foram avaliadas por meio de marcadores moleculares RAPD e SCAR. Os experimentos foram realizados em casa de vegetação e no Laboratório de Biotecnologia do Nupagri. Os resultados da análise de divergência genética, usando marcadores RAPD, geraram 92 bandas polimórficas de DNA em 40 acessos. As distâncias genéticas foram estimadas analisando a presença ou a ausência de bandas. A partir do complemento aritmético do índice de Jaccard foram realizadas análises de agrupamento utilizando os métodos de Tocher e UPGMA (Unweighted Pair- Group Method, Arithmetic Average). O método Tocher possibilitou a formação de 10 grupos distintos. Entretanto, através do método de UPGMA, os acessos foram agrupados de acordo com seus respectivos centros de origem em três grupos. Os resultados obtidos pelo método de UPGMA demonstraram que Carioca Pitoko e Iapar 31 foram os acessos mais similares. Por sua vez, a maior dissimilaridade foi observada entre BGF9 e os acessos Carioca Pitoko e Iapar 31. A análise molecular dos 40 acessos permitiu identificar a presença do marcador molecular SF10(1072) (ligado ao gene Co-10), e, ou ao SAS13(950) (ligado ao alelo Co-4²), em 23 deles. Os acessos Carioca Claro, Preto III, BGF12 e BGF13 exibiram a presença dos dois marcadores moleculares testados. Portanto, esses acessos provavelmente apresentam o gene de resistência Co-10 e o alelo Co-4², este último confere resistência a todas as raças do C. lindemuthianum. O marcador ligado ao alelo Co-4² foi observado nos acessos Carioca I, Carioca IV, Jalo Pardo, BGF3, BGF4, BGF6, BGF8, BGF11, BGF14, BGF16, BGF17, BGF19 e BGF20. No entanto, os acessos Carioca V, Carioca VI, Carioca Pintado I, Preto I e Preto II mostraram a presença do marcador ligado ao gene Co-10. A análise molecular das 233 isolinhas F2RC3, do retrocruzamento (Pérola x G 2333), revelou a presença do marcador molecular SAS13950 em 80 delas. A variabilidade genética observada nos acessos do Banco de Germoplasma do Nupagri poderá ser explorada em programas de melhoramento. As análises SCAR demonstraram que 23 acessos apresentaram marcadores moleculares ligados a genes que conferem resistência à antracnose.
Palavras-chave Colletotrichum lindemuthianum, Feijoeiro, Germoplasma, RAPD
Title
Abstract In order to quantify the genetic variability and identify resistant sources to anthracnose, 40 accessions of common bean from Núcleo de Pesquisas Aplicadas à Agricultura (Nupagri), of Universidade Estadual de Maringá (UEM) and 233 F2RC3 lines, derived from the backcross Pérola x G 2333 were evaluated through RAPD and SCAR molecular markers. The experiments were carried out at greenhouse and Biotechnology Laboratory of Nupagri. The results of genetic divergence analysis, using RAPD markers, generated 92 DNA polymorphic bands in accessions. The gentic distances were estimated analyzing the presence or absence of bands. From arithmetic complement of Jaccard’s index were formed clustering analyses using the methods of Tocher and UPGMA (Unweighted Pair-Group Method based on Arithmetic Averages). The Tocher method turned possible the formation of 10 distinct groups. However, through the method of UPGMA, the accessions were clustering according to their respective origin center in three groups. The results obtained by UPGMA Method demonstrated that Carioca Pitoko and Iapar 31 were the most similar accessions. On the other hand, the higher dissimilarity was observed between BGF9 and the accessions Carioca Pitoko and Iapar 31. The molecular analysis of 40 accessions allowed to identify the presence of molecular markers SF10(1072) (linked to Co-10 gene), and, or SAS13(950) (linked to Co-4² allele) in 23 of them. The accessions Carioca claro, Preto III, BGF12 and BGF13 exhibited the presence of the two molecular markers tested. Thus, these accessions probably present Co-10 gene of resistance and Co-4² allele, the last one confers resistance to all races of C. lindemuthianum. The marker linked to Co-4² allele was observed in accessions Carioca I, Carioca IV, Jalo Pardo, BGF3, BGF4, BGF6, BGF8, BGF11, BGF14, BGF16, BGF17, BGF19 and BGF20. However, accessions Carioca V, Carioca VI, Carioca pintado I, Preto I and Preto II showed the presence of marker linked to Co-10 gene. The molecular analysis of 233 F2RC3 lines, from crossing (Pérola x G 2333), revealed the presence of SAS13(950) molecular marker in 80 of them. In conclusion, the genetic variability observed in accessions could be explored in breeding programs. In addition, SCAR analysis demonstrated that 23 accessions possess moleculars markers linked to the genes that confer resistance to anthracnose.
Key-words Colletotrichum lindemuthianum, Common bean, Germplasm, RAPD
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