Terça, 18 de junho de 2024.
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Tese
Título Desenvolvimento de ensaios para marcadores SNPs associados à resistência da soja ao Meloidogyne incognita
Autor Dubiela , Carla Rosa
Unidade Pós-Graduação em Genética e Melhoramento
Área de Concentração Genética e Melhoramento
Orientador Eliezer Rodrigues de Souto
Co-Orientador(es) Ivan Schuster.
Banca Examinadora Adriana Gonela
Dauri José Tessmann
Fabiane Lazzari
Ivan Schuster
Data de Defesa 18/08/2016
Resumo significativas na produção de soja. Cultivares resistentes, em combinação com rotação de cultura com espécies não hospedeiras, são fatores importantes na redução das perdas de produção causadas por nematoides de galhas. Lazzari (2014) em um estudo de associação genômica, identificou marcadores SNPs em soja associados à resistência à M. incognita. Os marcadores mais informativos identificados neste estudo, foram utilizados individualmente no presente trabalho para a obtenção de marcadores TaqMan® únicos, com o objetivo de validar um protocolo de genotipagem de SNPs associados à resistência à M. incognita em soja e com isso, estabelecer uma rotina de SAM no programa de melhoramento de soja da Coodetec. Para tal validação, adotou-se o sistema TaqMan® para genotipagem, em cultivares provenientes de banco de germoplasma da Coodetec e em populações segregantes. Dos oito ensaios TaqMan® testados, somente três deles foram validados, pela genotipagem de um conjunto de 167 cultivares de soja, sendo que, 128 dessas cultivares foram as mesmas utilizadas por Lazzari (2014) para a identificação dos marcadores através de estudo de associação genômica e constatou-se que os genótipos obtidos pelos três marcadores foi o mesmo para as 128 cultivares utilizadas na identificação dos marcadores. A seleção assistida pelos marcadores quanto à reação aos nematoides de galhas pode ser utilizada em conjunto com a avaliação fenotípica, para reduzir o número de linhagens a serem avaliadas fenotipicamente. Na avaliação da eficiência do uso dos marcadores SNPs na seleção da resistência da soja à M. incognita em uma população independente de linhagens de soja, utilizando-se esta estratégia, a utilização do marcador GM10-1586434 apresentou uma eficiência de 96%, uma vez que as 20 linhagens com genótipo de resistência para o marcador e suscetíveis no fenótipo são reclassificadas após a avaliação fenotípica. Com isso, 92,3% das linhagens resistentes seriam selecionadas, com redução de 30% das análises fenotípicas para este grupo de linhagens. Para os marcadores GM10-831916 e GM10-981062, utilizando-se a mesma estratégia, a eficiência de seleção foi de 94%. A validação de marcadores moleculares voltada para SAM pode possibilitar um aumento na produtividade, uma vez que pode contribuir com a diminuição de tempo e custos para a geração de cultivares resistentes.
Palavras-chave Meloidogyne incognita; SAM; Marcadores SNP; Ensaio TaqMan®;
Title
Abstract Root knot nematode Meloidogyne incognita are responsible for significant losses in soybean production. Resistant cultivars in combination with crop rotation with non- host species, are important factors in reducing production losses caused by root knot nematode. Lazzari (2014) in a genome association study identified SNPs in soybean markers associated with resistance to M. incognita. The most informative markers identified in this study, were individually used in this work for obtaining unique TaqMan® markers, in order to validate a protocol genotyping SNPs associated resistance to M. incognita in soybean and thus establish a MAS routine in soybean breeding program Coodetec. For this validation, it adopted the TaqMan® system for genotyping in cultivars from the germplasm bank of Coodetec and segregating populations. Of the eight TaqMan® assays, only three of them were validated by genotyping a group of soybean cultivars 167, and 128 of these cultivars were the same used by Lazzari (2014) for identifying the markers via genome association study and it was found that the genotypes obtained for the three markers was the same for the 128 lines used in the identification of markers. Predictive markers for selection for resistance to root knot nematode can be used in conjunction with the phenotypic evaluation, to reduce the number of lines to be phenotypically evaluated. In evaluating the efficiency of use of SNP markers in the selection of soybean resistance to M. incognita in an independent population of soybean lines, using this strategy, the use of GM10-1586434 marker showed a 96% efficiency, as the 20 strains with resistance genotype for the marker and the susceptible phenotype are reclassified after phenotypic evaluation. Thus, 92.3% of resistant strains would be selected, with 30% of the phenotypic analysis for this group of strains. For GM10-831916 and GM10-981062 markers, using the same strategy, the selection efficiency was 94%. The validation of molecular markers toward MAS can allow an increase in productivity, since it can contribute to reduction of time and costs for the generation of resistant cultivars.


Key-words Meloidogyne incognita; MAS; SNP Markers; TaqMan® assay; Soybean.
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