Sexta, 19 de agosto de 2022.
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Tese
Título Análise da diversidade genética de germoplasma brasileiro de trigo utilizando alta densidade de marcadores SNPs
Autor Scherloski, Adriana
Unidade Pós-Graduação em Genética e Melhoramento
Área de Concentração Genética e Melhoramento
Orientador Alessandro Lucca Braccini
Co-Orientador(es) Ivan Schuster e Dr. Ronald José Barth Pinto.
Banca Examinadora Fabiane Lazzari
Telmo Antonio Tonin
Ivan Schuster
Hugo Zeni Neto
Data de Defesa 08/12/2016
Resumo A conservação da diversidade genética de espécies vegetais tem sido considerada um tema de grande relevância na atualidade, visto que o sucesso de qualquer programa de melhoramento ou de conservação depende do conhecimento da quantidade de variação presente na espécie de interesse. O objetivo deste trabalho foi analisar, pela primeira vez no Brasil, a diversidade genética existente no germoplasma brasileiro de trigo, com a utilização de alta densidade de marcadores SNPs. Foram genotipadas 211 variedades com 35.143 SNPs e realizadas análises de distância genética pelo método IBS, análise de agrupamento pelo método UPGMA e análise de componentes principais. Após filtragem dos dados, 10.049 marcadores foram utilizados nas análises, com uma média de 478,5 SNPs por cromossomo, variando de 207 marcadores no cromossomo 4D a 767 marcadores no cromossomo 5B. Deste total de marcadores, 3.808 estão no genoma A, 3.429 no genoma B e 2.762 no genoma D. As estimativas das distâncias genéticas variaram entre 0,013 e 0,471, sendo que a maior frequência encontra-se entre as 0,31 e 0,35. Foram identificados 12 grupos distintos de variedades, sendo que os dois maiores possuem 75 e 71 variedades cada, totalizando 69,1% das variedades em apenas dois grupos. As distâncias genéticas entre as variedades analisadas por década de lançamento variaram de 0,024 a 0,448, com maior frequência para as distâncias 0,31-0,4, ou seja, a similaridade genética para tais variedades encontra-se entre 60 e 69%. Com os resultados obtidos utilizando alta densidade de marcadores SNPs, observa-se que a variabilidade genética do trigo no Brasil tem permanecido predominantemente acima de 30%, durante os últimos 75 anos, com um ligeiro aumento da variabilidade com o tempo.
Palavras-chave diversidade genética; alta densidade; marcadores SNPs.
Title
Abstract The genetic diversity conservation of plant species have been considered a highly relevant topic nowadays, taking into account that the success of any breeding or conservation program depends on the knowledge of quantity of variations present in the species of interest. The aim of this project was to analyze, for the first time in Brazil, the genetic diversity in Brazilian wheat germplasm, using a high-density SNPs markers. 211 varieties were genotyped with 35,143 SNPs, and the genetic distance analysis were made through IBS methodology, clustering analysis with UPGMA method and main component analysis. 10,049 markers were used for analysis, after having filtered the data, with an average of 478.5 SNPs per chromosome, ranging from 207 markers in chromosome 4D to 767 markers in chromosome 5B. From these total markers, 3,808 are in genome A, 3,429 in genome B and 2,762 in genome D. Estimates obtained through genetic distances vary between 0.013 and 0.471, and the highest frequency is between the distances 0.31 and 0.35. It was possible to identify 12 distinct groups of varieties, being that the two largest one having 75 and 71 varieties each, totalizing 69.1% varieties in only two groups. The genetic distance between analyzed varieties that were released each decade varied from 0.024 to 0.448, with the highest frequency among the distances being 0.31-0.4, in other words, the genetic similarity of such varieties is between 60 and 69%. With the results obtained using high density of SNPs markers, it was possible to observe that the wheat genetic variability in Brazil has remained above 30% during the last 75 years, with a slight increase on the variability over time.

Key-words genetic diversity; high-density; SNPs markers.
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