Tese
Título	Mapeamento fino do alelo de resistência à antracnose Co-14 presente na cultivar de feijão comum AND 277
Autor	Lima , Laíze Raphaelle Lemos
Unidade	Pós-Graduação em Genética e Melhoramento
Área de Concentração	Genética e Melhoramento
Orientador	Maria Celeste Gonçalves Vidigal
Co-Orientador(es)	Vanusa da Silva Ramos Martins
Banca Examinadora	Mariana Vaz Bisneta Vanusa da Silva Ramos Martins Claudia Tomasella Alexandre Santana Gilio
Data de Defesa	28/08/2020
Resumo	Dentre os principais fatores limitantes responsáveis por expressivas perdas na produção e na qualidade de grãos do feijão comum, à antracnose destaca-se entre as principais doenças fúngicas que acometem a cultura. A utilização de cultivares resistentes é o método mais eficiente no controle da antracnose, devido à elevada variabilidade apresentada pelo patógeno. A utilização de mapas genéticos permitem a otimização e a busca de locos associados à resistência, bem como a ligação de marcadores a estes. A cultivar AND 277, é uma importante fonte de resistência à antracnose que possui o alelo Co-14 mapeado no cromossomo Pv01. Prévios estudos mapearam no final do Pv01 o locus Co-1 e os genes Co-14, Co-Pa, Co-AC, Co-x e CoPV01CDRK. Este estudo teve como objetivo o mapeamento genético de alta resolução do alelo Co-14 presente na cultivar AND 277, utilizando linhagens recombinantes endogâmicas derivadas do cruzamento entre Rudá × AND 277. Os resultados revelaram que o alelo Co-14 foi flanqueado entre os marcadores SNP ss715645251 e BARCPVSSR01356, nas respectivas posições genômicas 50.301.592 pb e 50.342.103 pb, no qual abrange uma região genômica de aproximadamente 40,511 Kpb. De acordo com o genoma de referência, esta região genômica contém dois genes candidatos: o Phvul.001G243800, que codifica uma proteína serina / treonina-proteína quinase relacionada ao ccr3; e o Phvul.001G243900, que codifica dupla Proteína da superfamília das hidrolases de trifosfato de nucleosídeo. Os resultados deste estudo mostraram que o alelo Co-14 está posicionado no locus Co-1 da cultivar Michigan Dark Red Kidney no grupo de ligação Pv01. Portanto, conclui-se que os marcadores ss715645251 e SSR BARCPVSSR01356 serão ferramentas importantes para programas de melhoramento visando a obtenção de novas cultivares contendo o alelo Co-14 por meio da seleção assistida por marcadores.
Palavras-chave	Phaseolus vulgaris, mapeamento, marcadores SNP, Colletotrichum lindemuthianum, cluster gênico.
Title
Abstract	Among the main limiting factors responsible for significant losses in the production and quality of common bean grains, anthracnose stands out among the main fungal diseases that affect the crop. The search for durable genetic resistance is still considered the primary method of anthracnose control, due to the high variability presented by the pathogen. The use of genetic maps allows the optimization and search of loci associated with resistance and the connection of markers to them. They also provide the identification of genes and proteins linked to the metabolic pathways of resistance response. The AND 277 cultivar is an important source of resistance to anthracnose that has the Co-14 allele mapped on chromosome Pv01. Previous studies have mapped the Co-1 locus and the Co-14, Co-Pa, Co-AC, Co-x and CoPV01CDRK genes at the end of Pv01. This study had as objective to fine mapping the Co-14 allele present in the AND 277 cultivar, using recombinant inbred lines derived from the cross between Rudá × AND 277. The results revealed that the Co-14 allele is flanked by the markers ss715645251 and BARCPVSSR01356, in the respective genomic positions 50,301,592 bp and 50,342,103 bp, which covers a genomic region of approximately 40,511 Kpb. According to the reference genome, this genomic region contains two candidate gene models are described for the Co-14 region: Phvul.001G243800, which encodes a serine/threonine-protein kinase-like protein ccr3-related and Phvul.001G243900, which encodes double clp-n motif-containing p-loop nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein. The results of this study showed that the Co-14 allele is positioned in the Co-1 locus of the Michigan Dark Red Kidney cultivar in the link group Pv01. Therefore, it is concluded that the ss715645251 and SSR BARCPVSSR01356 markers will be important tools to breeding programs aiming to obtain new cultivars containing the Co-14 allele through marker assisted selection.
Key-words	Phaseolus vulgaris, mapping, SNP markers, Colletotrichum lindemuthianum, gene cluster.
Arquivos	Nome Tamanho d-lrllima.pdf 1.598,94 KB

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