Tese
Título	Mapeamento de QTL para caracteres morfoagronômicos na população endogâmica de feijão comum Califórnia Dark Red Kidney × Yolano
Autor	CALVI, ALEXANDRE CATTO
Unidade	Pós-Graduação em Genética e Melhoramento
Área de Concentração	Genética e Melhoramento
Orientador	MARIA CELESTE GONÇALVES VIDIGAL
Co-Orientador(es)	INDISPONÍVEL
Banca Examinadora	CLAUDIA TOMASELLA GISELI VALENTINI JULIO CESAR FERREIRA ELIAS MARIA CELESTE GONCALVES VIDIGAL MARIANA VAZ BISNETA
Data de Defesa	13/01/2023
Resumo	O feijão comum (Phaseolus vulgaris L.), leguminosa cultivada em todo o mundo. É uma fonte relativamente barata de proteínas e nutrientes, estabelecendo-se como uma fonte importante alimento na manutenção da segurança alimentar no mundo. Nesse sentido, o melhoramento genético é essencial para a obtenção de cultivares mais produtivas, com arquitetura de plantas mais adequada aos sistemas de colheita, com ciclo adequado as regiões de produção e tipo de grão compatível com as exigências do mercado. Uma ferramenta auxiliar no melhoramento de plantas é a seleção assistida por marcadores de DNA. O mapeamento de ligação (LM) é a abordagem mais comum para detectar marcadores moleculares associados a locos de características quantitativas (QTL). A abundância de marcadores moleculares no genoma de algumas espécies fez do mapeamento de associação uma nova metodologia para detecção de QTLs. Dessa forma, a UCDavis, sob a supervisão do professor Doutor Paul Gepts, desenvolveu a população RIL CY, composta por 110 RILs, obtido a partir do cruzamento entre Califórnia Dark Red Kidney (CDRK) × Yolano, para construir um mapa genético e detectar QTLs relacionados a sete características morfo- agronômicas. A população foi genotipada com 3.227 SNP (single nucleotide polimorfismo) e fenotipados em condições de campo para número de dias para o florescimento (NDF), altura de planta (ALTP), produtividade (PROD), peso de 100 sementes (M100S), número de sementes por vagem (NSV), altura de inserção de primeira vagem (AIPV) e número de vagens por planta (NVP). Um mapa genético abrangendo um tamanho total de 936,341 cM, foi obtido por análise de ligação. Além disso, 30 QTLs foram detectados para as seis características distribuídos em 08 cromossomos, que explicaram de 0,80 a 39,56% da variação fenotípica. Conclui-se que o tamanho da população RILs CY (110 linhagens) permitiu obter um mapa genético com estimativas precisas de frequência de recombinação. O número de marcadores usados neste estudo forneceu boa saturação em todos os cromossomos, o que permitiu a detecção de QTL de forma eficiente e confiável por mapeamento de ligação. Os genes candidatos localizados nas regiões desses os QTLs corroboram seu potencial na seleção assistida por marcadores para essas seis características morfoagronômicas.
Palavras-chave	Feijão comum;população RIL;QTL;CDRK;Yolano
Title
Abstract	Abstract: The common bean (Phaseolus vulgaris L.), a legume grown all over the world. It is a relatively cheap source of protein and nutrients, establishing itself as an important source of food and maintenance of food security in the world. In this sense, genetic improvement is essential for the market adequacy of more productive cultivars, with plant architecture more suited to harvesting systems, with an adequate cycle according to the production regions, with the requirements compatible with the harvesting systems. An auxiliary tool in plant improvement is a selection assisted by DNA indicators. Linkage mapping (LM) is the most common approach to identify molecular markers associated with quantitative trait loci (QTL). A series of molecular markers in the genome of species have made association mapping a new methodology for detecting QTLs. Thus, UCDavis, under the supervision of Professor Paul Gepts, developed the RIL CY population, composed of 110 RILs, developed from the study between California Dark Kidney (CDRK) × Yolano, to build a genetic map and detect QTLs related to seven morpho-agronomic traits. The population was genotyped with 3,227 SNP (single nucleotide polymorphism) and phenotyped under field conditions for number of days to flowering (NDF), plant height (ALTP), yield (PROD), weight of 100 seeds (M100S), number of seeds per pod (NSV), height of first pod insertion (AIPV) and number of seeds per plant (NVP). A genetic map covering a total size of 936.41 cm was performed by linkage analysis. In addition, 3 QTLs were found for the traits distributed in 08 chromosomes, which explain from 0.80 to 39.56% of the phenotypic. It is concluded that the size of the CY RILs (110 lineages) needs to obtain a genetic map with recombination frequency estimates. The number of markers is provided with good evaluation on all used chromosomes, which makes efficient way of QTL protection and protection by this linkage mapping. Specific genes corroborate in the regions of these QTLs their potential in marker-assisted selection for these morphoagronomic traits.
Key-words	Common bean;RIL population;QTL;CDRK;Yolano
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