Terça, 28 de maio de 2024.
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Dissertação
Título Utilização de marcadores SSR na avaliação da distância genética entre progênies tropicais e temperadas de milho-pipoca
Autor Trindade, Ana Paula Ribeiro
Unidade Pós-Graduação em Genética e Melhoramento
Área de Concentração Genética e Melhoramento
Orientador Prof. Dr. Ronald José Barth Pinto
Co-Orientador(es) Prof. Dr. Carlos Alberto Scapim
Profª Drª Maria de Fátima Pires da Silva Machado
Profª Drª Maria Celeste Gonçalves Vidigal
Banca Examinadora Prof. Dr. Ronald José Barth Pinto
Prof. Dr. Adilson Ricken Schuelter
Profª Drª Maria de Fátima Pires da Silva Machado
Data de Defesa 16/04/2007
Resumo Uma das estratégias para o melhoramento de milho-pipoca parte da utilização de distintos germoplasmas visando a exploração prática da heterose. A escolha dos genitores pode ser auxiliada por meio dos marcadores moleculares. Com o objetivo de estimar a distância genética entre progênies tropicais e temperadas de milho-pipoca, foi avaliadas oito progênies 85 de diversas origens (híbrido triplo Zélia, CMS42, CMS43, UEM-M2 e híbrido americano Zaeli), utilizando marcadores microssatélites. A extração de DNA foi realizada segundo a metodologia de Hoisington. O programa Touchdown PCR foi utilizado na amplificação de 15 primers polimórficos de um total de 51 microssatélites avaliados. A distância genética foi estimada pelo índice de diversidade de Nei e pela distância modificada de Rogers, através do programa Genes. Houve uma grande participação da diversidade dentro em relação à diversidade total entre as progênies. As progênies P3-3, P4-4, P7-4 e P8-2 apresentaram maior participação da variabilidade dentro em relação à variabilidade entre. Os resultados indicaram níveis expressivos de desuniformidade genética dentro das progênies. A distância genética por Rogers evidenciou que a progênie P4-4 obteve o maior valor de heterozigosidade, enquanto P8-2, P7-3 e P4-2 apresentaram um nível relativamente baixo de polimorfismo. Houve menor identidade genética entre as progênies PI-3 e P8-1, e maior identidade entre P3-3 e P8-2. Os valores de PIC foram proporcionais a heterozigosidade média. A correlação cofenética permitiu a seleção do método UPGMA na escolha do dendograma mais apropriado para discriminar as progênies em cinco grupos, como também verificado pelo método de agrupamento de Tocher. Considerando a heterozigosidade de cada progênie e tendo em vista que o agrupamento esperado entre as progênies de mesma origem não foi observado por tais metodologias, foi realizada uma análise complementar, com a exclusão de cinco primers associados a níveis altos de heterozigosidade. A maior heterozigosidade média foi verificada na progênie P4-4 e a menor, na progênie P7-3. Houve uma redução geral na heterozigosidade, embora diferenciada entre as progênies. Entre os quatro grupos, foi confirmado o agrupamento P3-3/P7-3/P8-2 e observado o alinhamento de duas progênies de mesma origem (P4-2/P4-4). A seleção de primers aumentou o grau de coincidência entre alguns grupos identificados pêlos marcadores SSR e os agrupamentos naturais sugeridos pela genealogia. Embora os resultados não permitam indicar grupos potencialmente heteróticos, ambas as análises de distanciamento coincidiram em apontar maior divergência entre grupos contendo as linhagens P 1-3 e P8-1.
Palavras-chave Zea mays L., Microssatélites, Distância genética, Milho-pipoca
Title Use of SSR markers in the evaluation of genetic distance between tropical and tempered lineages of maize-popcorn
Abstract One of the strategies for the maize-popcorn improvement has left of the use of distinct germplasm aiming at the practical exploration of heterosy. The choice of the genitors can be assisted by means of the molecular markers. With the objective esteem in the distance genetic between tropical and tempered lineages of maize-popcorn, it was evaluated eight S6 lineages of diverse origins (hybrid Zélia triple, CMS42, CMS43, UEM-M2 and American hybrid Zaeli), using microssatellite markers. The extraction of DNA was carried through according to methodology of Hoisington. The program Touchdown PCR was used in the amplification of 15 polymorphic, primers of a total of 51 evaluated microssatelites. In the distance genetic it was esteem by the index of diversity of Nei and for in the distance modified of Rogers, through the program Genes. It inside had a great participation of the diversity m relation to the total diversity between the lineages. The lineages P3-3, P4-4, P7-4 and P8-2 had presented greater participation of the variability inside in relation to the variability enter. The results had inside indicated expression levels of genetic no- uniform of the lineages. In the distance genetic for Rogers it evidenced that the P4-4 lineage got the biggest value of heterozygousity, while P8-2, P7-3 and P4-2 had presented a relatively low level of polymorphism. It had minor genetic identity between the lineages PI-3 and P8-1, and greater identity between P3-3 and P8-2. The values of PIC had been proportional to the average heterozygousity. The splenetic correlation allowed the election of method (JPGMA in the choice of the dendogram most appropriate to discriminate the lineages in five groups, as well as verified for the method of grouping of Tocher. Considering the heterozygousity of each lineage and in view of that the waited grouping enters the lineages of same origin was not observed by such methodologies, a complementary analysis was carried through, with the exclusion of five primers associates the high levels of heterozygousity. The biggest average heterozygousity was verified in the P4-4 lineage and the minor, in the P7-3 lineage. It had a general reduction in the heterozygousity, even so differentiated between the lineages. Between the four groups, grouping P3-3, P7-3, P8-2 was confirmed and observed the alignment of two lineages of same origin (P4-2, P4-4). The election of primers increased the coincidence degree enters some groups identified for markers SSR and the natural groupings suggested by the genealogy. Although the results do not allow to indicate potentially heterotic groups, both the distance analyses had coincided in pointing greater divergence between groups contend the ancestries PI-3 and P8-1.
Key-words Zea mays L., Microsatellites, Genetic distance, Maize popcorn
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