Dissertação |
Título |
Divergência genética entre genótipos de milho-pipoca utilizando microssatélites em bulk de DNA genômico |
Autor |
Silva, Tereza Aparecida |
Unidade |
Pós-Graduação em Genética e Melhoramento |
Área de Concentração |
Genética e Melhoramento |
Orientador |
Prof. Dr. Ronald José Barth Pinto |
Co-Orientador(es) |
Profª Drª Claudete Aparecida Mangolin Prof. Dr. Carlos Alberto Scapim Profª Drª Maria de Fátima Pires da Silva Machado |
Banca Examinadora |
Prof. Dr. Ronald José Barth Pinto Prof. Dr. Antonio Teixeira do Amaral Junior Profª Drª Claudete Aparecida Mangolin Prof. Dr. Carlos Alberto Scapim Profª Drª Maria de Fátima Pires da Silva Machado |
Data de Defesa |
26/02/2008 |
Resumo |
A diversidade genética entre 25 genótipos de milho-pipoca foi estimada utilizando-se bulks de DNA genômico formados por 78 plantas de cada variedade. Para esta estimativa foram utilizados 23 primers microssatélites distribuídos em 9 cromossomos. Um total de 100 alelos distintos foi detectado entre as variedades. O número de alelos por loco variou de 2 a 7. Os índices de dissimilaridade genética foram obtidos com base na freqüência de alelos comuns às populações contrastadas. A matriz de dissimilaridades permitiu a realização de análises de agrupamento pelo método de Tocher e pelos métodos do vizinho mais próximo, vizinho mais distante e UPGMA. Os coeficientes de correlação cofenética de cada agrupamento indicaram que o método UPGMA foi o mais adequado entre os modelos hierárquicos utilizados para discriminar as variedades. Os resultados obtidos pela metodologia de Tocher apontaram a presença de quatro grupos de variedades, um dos quais constituído por 21 genótipos. O número de grupos indicado pelo método UPGMA foi superior ao obtido sob a metodologia de Tocher, evidenciando vantagens práticas do método das médias de distâncias na discriminação das variedades. As diferenças entre grupos indicadas pelo método UPGMA foram parcialmente decorrentes da influência de genótipos parentais preponderantes em cada cluster, tais como Zélia, Angela, IAC 112 e CMS 42. Apesar de algumas discrepâncias, grande parte dos clusters indicados pela análise molecular agrupou materiais de mesma origem parental. As variedades Argentina, Chile, PA-091 e PR-023 manifestaram grande dissimilaridade genética em relação às demais, razão pela qual a realização de cruzamentos dessas variedades com os demais genótipos avaliados pode ser uma alternativa promissora para a obtenção de heterozigose, supondo uma estratégia voltada à seleção e exploração de heterose. |
Palavras-chave |
Microssatélites, Bulks, Diversidade Genética, Milho-Pipoca. |
Title |
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Abstract |
Genetic diversity of 25 popcorn genotypes was estimated using bulked DNA samples obtained of 78 plants from each variety. The procedure involved 23 microsatellite loci distributed on 9 chromosomes of maize. A total of 100 alleles were detected among the genotypes. At each locus, the number of alleles varied from 2 to 7. The genetic dissimilarity coefficients were obtained based on the ratio between the number of SSR alleles common to both varieties and the total number of SSR alleles observed for that comparison. A matrix of dissimilarity allowed to perform clustering analysis according to the Tocher's method and to the hierarchical clustering proceeds (nearest neighbor clustering, furthest neighbor clustering and unweighted pair-group method using an arithmetic average - UPGMA). The cophenetic correlation coefficients for each clustering method pointed out to the UPGMA method as the most appropriated to explain the varietal discrimination. Tocher's method separated the genotypes into four groups, one of them formed by 21 genotypes. The number of clusters indicated by the UPGMA method was higher than the one obtained according the Tocher's method, making clear the practical advantages of the UPGMA method in discriminating varieties. Differences among groups under the UPGMA procedure were partially derived from the influence of the most frequent parental genotypes in each cluster, such as Zélia, Angela, IAC 112 and CMS 42. Despite some discrepancies, most of clusters suggested by the molecular analysis included genotypes with the same basic genealogy. Varieties Argentina, Chile, PA-091 and PR-023 showed a high genetic dissimilarity in relation to the others, so their crossings with the remaining genotypes are expected to increase heterozigosity, assuming a strategy facing to selection and heterosis exploitation. |
Key-words |
Microsatellites, Bulks, Genetic Diversity, Popcorn. |
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